Denne periode er også interessant, idet Ordenen træder frem og giver sig til kende. Det er endnu til her, den officielt genindsættes som "legitim"-Orden af Napoleon III.
Perioden afsluttes med anden verdenskrig, der gør, at Ordenen, måske lidt lært af tidligere tider, søger at undgå den Tyske invation. På det tidspunkt ledes Ordenen af en Stor Mester fra Belgien, der af frygt for Adolf Hitler, flytter Ordenens segl til Portugal i forvaring. Med klar ordre om, at seglet skal tilbage når krigen er ovre og tingene har normaliseret sig.
Dog falder seglet i de forkerte hænder viser det sig, idet lederen af den Portugisiske afdeling af Ordenen egenmægtig vælger at beholde det og udråber sig selv til ny Stormester. En handling der ikke på nogen måde var ligitim eller i overensstemmelse med praksis gennem århundreder, hvor Stormesteren altid er valgt af Ordenens medlemmer.